El análisis de ADN del suelo de la cueva de İnönü, en Turquía, revela una terapia con carbón vegetal de 5.000 años de antigüedad y antiguos genes de resistencia a los antibióticos.
El ADN antiguo recuperado de la cueva de İnönü, en la provincia de Zonguldak, en Turquía, ha revelado evidencia de que los pueblos prehistóricos utilizaban remedios a base de carbón vegetal para tratar enfermedades estomacales hace 5.000 años. El mismo estudio reveló que los genes de resistencia a los antibióticos existían milenios antes de los fármacos modernos, lo que redefine nuestra comprensión de la medicina antigua y la evolución microbiana.
Los hallazgos se publicaron recientemente en la revista PLOS ONE bajo el título Descifrando la vida microbiana pasada y la resistencia a los antibióticos en el suelo arqueológico de la cueva de İnönü.
Las excavaciones en la cueva de İnönü comenzaron en 2017 bajo la dirección del Prof. Asociado Dr. Hamza Ekmen de la Universidad Zonguldak Bülent Ecevit (ZBEU).
Ubicada en la región del Mar Negro, esta cueva volcánica alberga un manantial de agua dulce y estuvo habitada desde el Calcolítico (aprox. 4300 a. C.) hasta la Edad del Hierro.
Se extrajeron muestras de suelo de cuatro estratos culturales y se analizaron mediante secuenciación de ADN de alto rendimiento para reconstruir las antiguas comunidades microbianas.
El equipo de investigación, dirigido por el Prof. Asociado Dr. Şükran Öztürk (Facultad de Farmacia de la ZBEU) y el Prof. Asociado Dr. F. Gülden Ekmen (Arqueología de la ZBEU), descubrió que los habitantes de la región utilizaban materiales derivados del carbón con fines medicinales.
La evidencia sugiere que trataban las náuseas, la diarrea, el dolor de estómago y otros problemas digestivos con sustancias a base de carbón, una práctica que se repite en las terapias modernas con carbón activado.
Afirmó el Dr. Ekmen:
Estos hallazgos demuestran una notable continuidad del conocimiento médico. Lo que observamos en Zonguldak es que los pueblos prehistóricos comprendían y utilizaban los depósitos naturales de carbón de su entorno para tratar enfermedades mucho antes de la historia escrita.
El estudio también reveló la presencia de genes de resistencia a antibióticos con miles de años de antigüedad:
gen tetA (capa calcolítica, ca. 4300 a. C.): confiere resistencia a la tetraciclina.
gen intl1 (Edad del Bronce Temprano, ca. 3000 a. C.): un elemento móvil vinculado a la resistencia a múltiples fármacos.
gen OXA-58 (Edad del Bronce Final, ca. 1400 a. C.): asociado a la resistencia a los carbapenémicos.
Estos descubrimientos respaldan la hipótesis del resistoma, que sostiene que la resistencia a los antibióticos evolucionó en las bacterias del suelo mucho antes de que los humanos desarrollaran los antibióticos farmacéuticos.
Explicó el Dr. Öztürk:
La resistencia a los antibióticos no es solo una consecuencia del uso moderno de medicamentos, sino un rasgo ecológico profundamente arraigado. Factores ambientales como la geología volcánica, las fuentes de agua ricas en minerales y las prácticas médicas prehistóricas probablemente moldearon la evolución microbiana a lo largo de miles de años.
Los investigadores identificaron importantes grupos bacterianos como Acidobacteriota, Proteobacteria, Firmicutes, Cyanobacteria y Actinobacteria, mapeando cómo las comunidades microbianas cambiaron junto con las actividades humanas.
Por ejemplo, las muestras de la Edad del Bronce Antiguo mostraron un aumento en Proteobacteria, vinculado a la ganadería y al aumento de la fertilidad del suelo, mientras que las muestras del Calcolítico fueron ricas en Cyanobacteria, lo que sugiere el uso de recursos acuáticos.
Este enfoque representa uno de los primeros estudios a gran escala de ADN antiguo de muestras de suelo en Turquía, expandiendo la arqueología más allá de los artefactos para incluir las huellas microbianas de la vida cotidiana.
La ubicación de la cueva de İnönü con vistas a valles fértiles cerca de la costa del Mar Negro la hizo ideal para el asentamiento prehistórico. La evidencia arqueológica muestra una habitación continua, con conchas importadas, objetos de cobre y cerámica que indican vínculos comerciales con las culturas de los Balcanes Orientales. Para finales de la Edad del Bronce, los artefactos sugieren contacto con regiones controladas por los hititas en Anatolia central.
La singular geología volcánica de la cueva proporcionó abundante carbón, azufre y aguas ricas en minerales. Estos recursos probablemente influyeron tanto en las dietas prehistóricas como en las prácticas de tratamiento, una teoría respaldada por la detección de residuos químicos y genes de resistencia asociados a compuestos naturales como los tintes de anilina, históricamente utilizados para aliviar el dolor.
El proyecto forma parte de la iniciativa Una Salud de Turquía, que integra arqueología, microbiología y ciencias ambientales para rastrear la evolución de la salud humana junto con los sistemas ecológicos. Las muestras de suelo se secuenciaron mediante la tecnología iSeq de Illumina, y los datos se archivan públicamente en el BioProject PRJNA1134133 del NCBI.
Los autores incluyen expertos de la Universidad Zonguldak Bülent Ecevit, el Laboratorio de Genética Evolutiva de la Universidad de Ankara y la Universidad de Carolina del Norte en Chapel Hill, lo que destaca el alcance internacional del trabajo.
Este estudio tiene importantes implicaciones:
Historia médica: Confirma el conocimiento prehistórico de las propiedades medicinales del carbón.
Evolución microbiana: Demuestra que los genes de resistencia a los antibióticos son antiguos y están moldeados por procesos naturales.
Innovación arqueológica: Demuestra el poder del ADN del suelo antiguo para reconstruir la vida cotidiana y la ecología de las enfermedades.
A medida que la humanidad se enfrenta a una creciente resistencia a los antibióticos, estos descubrimientos resaltan el valor de la arqueología para comprender las crisis sanitarias modernas.
Afirmó el Dr. Öztürk:
A menudo esperamos soluciones, pero a veces las respuestas se encuentran enterradas en el pasado.
Ozturk S, Ekmen F, Ekmen H, Ünal EM, Er A, Keskin E, et al. (2025) Decoding past microbial life and antibiotic resistance in İnonü Cave’s archaeological soil. PLoS One 20(7): e0326358. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0326358
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